De hoogleraar sociale psychologie is in opspraak geraakt doordat hij op de wetenschappelijke blog Retraction Watch onder een andere naam probeerde zijn eigen naam te zuiveren. Daarop hebben de beheerders van dit blog, Retraction Watch, Stapel aan de digitale schandpaal genageld. Stapel gebruikte voor de reacties op hemzelf de schuilnaam 'Paul'. De redactie van Retraction Watch kreeg argwaan door de verdacht positieve commentaren die deze 'Paul' achterliet. In de media zegt Stapel hierover: 'Ik besloot -als grap, niet slim achteraf- met de discussie mee te doen, ook met een pseudoniem. In mijn rol als pseudoniem riep ik mensen op om, als ze vragen voor Diederik Stapel hebben, 'hem' gewoon een e-mail te sturen en/of zijn website te bezoeken. Het is makkelijk om over iemand te praten, maar het is wellicht interessanter om met iemand in gesprek te gaan.' Dit schrijft Omroep Brabant. Ook laat Stapel weten 'dat de website wist wie achter het pseudoniem zat'. Stapel tegen Omroep Brabant:' Maar ze vonden dat ik geen schuilnaam mocht gebruiken in deze discussie.'
Stapel geeft zijn fout toe, maar komt ook voor zichzelf op. Tegen de Omroep zegt zegt hij verder: 'Ik geloof dat ik het recht heb om mezelf te verdedigen tegen geschreeuw en geschop. Op een gegeven moment (na ruim drie jaar) is het genoeg. In het vervolg zal ik dat altijd onder mijn eigen naam doen, ook op websites waar veel andere mensen pseudoniemen gebruiken. Zie het als een daad van pure wanhoop, niet slim zak!, maar wel uit het diepst van mijn hart. Ik heb mijn les weer geleerd.'
Stapel die als gastdocent filosofie verbonden was aan Fontys is daar inmiddels weer opgestapt.