Na zorgvuldig onderzoek is deze commissie in haar eindrapport tot de conclusie gekomen dat alle klachtonderdelen ongegrond zijn. Het College van Bestuur (CvB) van de Vrije Universiteit Amsterdam (VU) heeft besloten dit rapport integraal over te nemen en is tevreden dat er geen sprake is geweest van schending van de wetenschappelijke integriteit door deze drie voormalige medewerkers van de VU.
Op 12 juni 2014 is bij de ombudsman wetenschappelijke integriteit van de VU een anonieme klacht binnengekomen over data-acquisitie en verwerking ten behoeve van onderzoek dat verricht is door Nijkamp, Kourtit en Baycan-Levent. Het CvB heeft geoordeeld dat de klacht zodanig gedetailleerd en onderbouwd was dat niet op voorhand kon worden uitgesloten dat de gemaakte verwijten gegrond waren, terwijl de klacht ook zonder verdere medewerking van de anonieme klager onderzocht kon worden.
Voor Nijkamp en Kourtit is dit de derde keer dat tegen hen een anonieme klacht is ingediend. Vinod Subramaniam, rector magnificus: “De inhoud van die klachten was steeds zodanig concreet dat het CvB tot het oordeel moest komen dat deze klachten niet zonder nader onderzoek terzijde konden worden gelegd. Het CvB is echter ook van mening dat nu alles in deze zaak voldoende onderzocht is en zal dan ook geen nadere anonieme klachten tegen betrokkenen meer in behandeling nemen.”
Publicaties uit het proefschrift van Kourtit zijn niet onderzocht, aangezien de leescommissie van het betreffende proefschrift zich daar reeds eerder over had gebogen en geen onrechtmatigheden aantrof. Plagiaat is door de onderzoekscommissie buiten beschouwing gehouden, omdat deze meldingen overlapten met onderzoek daar eerder werd gedaan door de onderzoekscommissie Zwemmer. Het CvB heeft in dit geval met instemming van de betrokkenen besloten tot publicatie van het volledige rapport, om zo optimale transparantie te bereiken.